La AEN, además de constituida por las diferentes Asociaciones Autonómicas, desarrolla su actividad a través de diversas secciones y grupos de trabajo específicos, concretamente:
- Sección de Psicoanálisis.
- Sección de Rehabilitación.
- Sección de DD.HH.
- Sección de Historia.
- Sección Infanto-Juvenil.
- Grupo de trabajo de Terapia Ocupacional.
- Grupo de trabajo de Profesionales de Atención Directa.
En algunos de estos participan diferentes miembros de OME.